草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿设备最先见的病症一种。肾组识中CaOx尖晶石过达到饱和状态沉淀积累会出现肾小管受损细胞断裂和凋亡，以此出现肾结石的变成。短链皮脂酸由胃胃肠内好氧菌微生物堆肥伙食食物纤维形成，仅仅在边缘胃胃肠防线中激发的角色，还有就是在设备程度上也激发根本的角色。但其中，丁酸是最大量的短链皮脂酸，有消除炎症和免疫检测缓和的角色,本钻研讨论丁酸对CaOx肾结石的的角色举例隐性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山大医院泌尿内科吴忠客座教授、周子健院士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠院士、周子健搏士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物技术与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了微信网络药学学服務，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

原创文章品牌：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 朋友的单位：华山三甲医院 探讨人群：大鼠、HK-2癌细胞 分类内容：对比组（Con）、建模组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱展示工艺：线上药理学学判断

工作思路标准步骤

探析結果

探究探讨考生要构造 大鼠建模工具，确认生物学什么是生化的指标和结构方面的问题学刺绣等探究探讨手法出现 丁酸都可以减轻CaOx建模工具大鼠肾CaOx结晶的产生和受损，提高CaOx建模工具大鼠的宫颈炎症受损和空气被氧化东西的过渡表明。凡此种种，丁酸还可治理和改善草酸诱导型的HK-2组织癌细胞受损、空气被氧化应激状态和组织癌细胞凋亡。 为与探讨丁酸节构和靶什么是dna组线上，研究探讨员工从PubChem添加丁酸和丁酸酯的二维和3D节构（图1A）。用PharmMapper统计orcale和Uniprot统计orcale加工后共挑选出1115个丁酸靶什么是dna组供进一部研究。将什么是dna组相信信息接入STRING统计orcale，完成PPI线上研究。Cytoscape明确了重新排列的前20的核心站靶什么是dna组的相信线上图，涵盖CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。那些核心站什么是dna组与线上中的别什么是dna组均表面出某种的注重性的性，证明那些什么是dna组或者充分调动出来着信息化功用。GO和KEGG研究反映了丁酸核心站什么是dna组的注重性的路经和动物学功能表（图1C）。核心站什么是dna组大部分与类固醇刺激发素回复、脱色物应激状态状态回复、吸附性氧体细胞对类固醇刺激发素激发的体现并且对弱酸性检查是否物质的体现关于 。以上指出，那些核心站什么是dna组大部分加入了脱色物应激状态状态和对吸附性氧的动物体现期间，是肾结石造成逻辑中至关注重的路经，这阐明丁酸或者在肾结石中充分调动出来注重功用。

图1| 丁酸组成部分与靶DNA电脑网络深入分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一点生命的进化丁酸对CaOx肾结石那就是切靶遗传什么是什么是表观遗传，探析关联的人采用GEO数据表格文件库对GSE73680中绿色相较比较与CaOx肾结石的人的遗传什么是什么是表观遗传互为引响来了探析。相较比较组与CaOx结石的人的差异性性互为引响表答遗传什么是什么是表观遗传（DEGs）挑选准则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个遗传什么是什么是表观遗传开展差异性引响，中仅3379个（89.4%）遗传什么是什么是表观遗传表答调涨，404个（10.6%）遗传什么是什么是表观遗传表答降低（图2A）。对DEGs来聚类分析深入分析法深入分析，热图体现 了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类分析深入分析法特性（图2B）。马上又，探析关联的人用GeneCards数据表格文件库人力认定了370个有机会与CaOx肾结石关联的遗传什么是什么是表观遗传，网站排名前20位的预估遗传什么是什么是表观遗传举例说明关联性评分标准就像文中2C如图所示。为了能让寻得丁酸根治CaOx肾结石的重要靶点，探析关联的人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关联遗传什么是什么是表观遗传解决得以一个Venn图。最后，CYP2C9被设定为丁酸引响CaOx肾结石的内在靶点(图2D)。不仅而且，探析关联的人还来了丁酸与CYP2C9的氧分子挂接，CYP2C9的多个有机酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互为功能，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在充分利用手机网络临床药理学分折CYP2C9是丁酸会影响CaOx肾结石的靶dna后，探索工人还按照肿瘤细胞膜实验室可确认了CYP2C9可消减草酸介导的HK-2肿瘤细胞膜的ROS平行、宫颈炎症断裂和凋亡。

图2| 半数以上据库共同具体分析预侧CYP2C9是丁酸做用于CaOx肾结石的靶dna

探索结杲

本探索一开始遇到丁酸在离体和内部均能遏制作用CaOx肾结石实体模型的钝化应激反应状态和支原体感染挤压伤，结尾经由网药剂学学挑选收获丁酸影响力CaOx肾结石的因素靶点——CYP2C9，结尾经由神经细胞系检测是因为CYP2C9在草酸盐介导的HK-2神经细胞系ROS标准、支原体感染挤压伤和凋亡。这个遇到是因为丁酸很有可能经由遏制作用CYP2C9来遏制作用CaOx肾结石的钝化应激反应状态，得到缓解支原体感染挤压伤。一种时候中拜谱菌物给予了网药剂学学技术设备性功能，然而拜谱菌物可的提升成熟期健全的人类基因组学、营养物质质组学、消化吸收组学等几组学物品及技术设备性功能，欢迎辞了解和咨询了解和咨询！ 参考使用文献资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.